MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 41563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015847	GAA	2	6	1744415	1744420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625030
41502	NC_015847	GATA	2	8	1744433	1744440	50 %	25 %	25 %	0 %	340625030
41503	NC_015847	TGG	2	6	1744489	1744494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625030
41504	NC_015847	TAT	2	6	1744509	1744514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625030
41505	NC_015847	TGA	2	6	1744522	1744527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625030
41506	NC_015847	AATA	2	8	1744550	1744557	75 %	25 %	0 %	0 %	340625030
41507	NC_015847	TTA	2	6	1744653	1744658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625030
41508	NC_015847	AAC	2	6	1744676	1744681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625030
41509	NC_015847	AAAT	2	8	1744683	1744690	75 %	25 %	0 %	0 %	340625030
41510	NC_015847	TGA	2	6	1744705	1744710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625030
41511	NC_015847	GAA	2	6	1744733	1744738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625030
41512	NC_015847	AAT	2	6	1744802	1744807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625030
41513	NC_015847	GAA	2	6	1744826	1744831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625030
41514	NC_015847	CAG	2	6	1744861	1744866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625030
41515	NC_015847	AT	4	8	1744868	1744875	50 %	50 %	0 %	0 %	340625030
41516	NC_015847	ACA	2	6	1745063	1745068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340625031
41517	NC_015847	TGC	2	6	1745097	1745102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625031
41518	NC_015847	ATA	2	6	1745251	1745256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625031
41519	NC_015847	TTG	2	6	1745282	1745287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625031
41520	NC_015847	ATTC	2	8	1745303	1745310	25 %	50 %	0 %	25 %	340625031
41521	NC_015847	A	6	6	1745327	1745332	100 %	0 %	0 %	0 %	340625031
41522	NC_015847	TAT	2	6	1745378	1745383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625031
41523	NC_015847	TCC	2	6	1745391	1745396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340625031
41524	NC_015847	TCT	2	6	1745425	1745430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625031
41525	NC_015847	AGA	2	6	1745439	1745444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625031
41526	NC_015847	AGT	2	6	1745448	1745453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625031
41527	NC_015847	GAT	2	6	1745460	1745465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625031
41528	NC_015847	TGT	2	6	1745466	1745471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625031
41529	NC_015847	AGA	2	6	1745475	1745480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625031
41530	NC_015847	CTT	2	6	1745521	1745526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340625031
41531	NC_015847	ATTG	2	8	1745539	1745546	25 %	50 %	25 %	0 %	340625031
41532	NC_015847	CGA	2	6	1745589	1745594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625031
41533	NC_015847	TGA	2	6	1745601	1745606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625031
41534	NC_015847	ATT	2	6	1745608	1745613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625031
41535	NC_015847	A	6	6	1745632	1745637	100 %	0 %	0 %	0 %	340625031
41536	NC_015847	TGGA	2	8	1745650	1745657	25 %	25 %	50 %	0 %	340625031
41537	NC_015847	AGA	2	6	1745715	1745720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625031
41538	NC_015847	A	6	6	1745740	1745745	100 %	0 %	0 %	0 %	340625031
41539	NC_015847	GAA	2	6	1745818	1745823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625031
41540	NC_015847	A	6	6	1745834	1745839	100 %	0 %	0 %	0 %	340625031
41541	NC_015847	T	6	6	1745852	1745857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41542	NC_015847	AAG	2	6	1745904	1745909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625032
41543	NC_015847	GTT	2	6	1745915	1745920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625032
41544	NC_015847	A	6	6	1746036	1746041	100 %	0 %	0 %	0 %	340625032
41545	NC_015847	ATT	3	9	1746047	1746055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340625032
41546	NC_015847	CTG	2	6	1746072	1746077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625032
41547	NC_015847	ATTC	2	8	1746085	1746092	25 %	50 %	0 %	25 %	340625032
41548	NC_015847	TGG	2	6	1746103	1746108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625032
41549	NC_015847	TGA	2	6	1746124	1746129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340625032
41550	NC_015847	CAG	2	6	1746180	1746185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340625032
41551	NC_015847	AAG	2	6	1746207	1746212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625032
41552	NC_015847	GT	3	6	1746235	1746240	0 %	50 %	50 %	0 %	340625032
41553	NC_015847	TGT	3	9	1746238	1746246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340625032
41554	NC_015847	TA	3	6	1746269	1746274	50 %	50 %	0 %	0 %	340625032
41555	NC_015847	GAA	2	6	1746298	1746303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340625032
41556	NC_015847	CTG	2	6	1746334	1746339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625032
41557	NC_015847	TGG	2	6	1746358	1746363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340625032
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41559	NC_015847	AAT	2	6	1746520	1746525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340625032
41560	NC_015847	TGC	2	6	1746589	1746594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340625032
41561	NC_015847	A	7	7	1746643	1746649	100 %	0 %	0 %	0 %	340625032
41562	NC_015847	A	7	7	1746657	1746663	100 %	0 %	0 %	0 %	340625032
41563	NC_015847	T	6	6	1746686	1746691	0 %	100 %	0 %	0 %	340625032

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.